Nicolás Zabalegui - Viernes 24 de Agosto 11:00hs

Estrategias analíticas para estudios metabolómicos de cáncer renal utilizando espectrometría de masas

Mediante la implementación de métodos estadísticos de análisis multivariado la metabolómica puede ser utilizada para descubrir potenciales biomarcadores para el diagnóstico, pronóstico y seguimiento de enfermedades. Los experimentos de metabolómica no dirigida utilizando espectrometría de masas permiten adquirir miles de señales de metabolitos en una única muestra. La estructura química de los iones detectados es a priori desconocida, siendo la identificación de metabolitos discriminantes uno de los desafíos más grandes en el campo. Por lo tanto, el procedimiento por el cual los datos crudos se convierten en información relevante del sistema biológico en estudio debe tener el nivel de confianza suficiente para validar el proceso de identificación.

En esta presentación, se mostrarán los principales resultados obtenidos al identificar metabolitos del exometaboloma de las líneas celulares renales humanas: 786-O (VHL-/-), Caki-1 (VHL+/+), y HEK 293, cuyos medios condicionados fueron analizados por cromatografía líquida de ultra alta performance acoplada a espectrometría de masas de alta resolución utilizando un espectrómetro de masas de cuadrupolo tiempo de vuelo. Dicho modelo in vitro se estudió con el objetivo de analizar el exometaboloma de células de Carcinoma Celular Renal de células claras (CCRcc), que es el tipo histológico más frecuente de CCR, y compararlo con el perfil metabólico de muestras séricas de pacientes con la enfermedad. También se expondrán resultados preliminares de un estudio relacionado en donde se implementó el mismo método analítico de UHPLC-QTOF-MS para el análisis de una cohorte de 240 muestras de pacientes con CCRcc con estadios I, II, III y IV e individuos sanos, con el objeto de identificar las vías metabólicas implicadas en la progresión tumoral y descubrir nuevos potenciales biomarcadores. Por último, se presentará la estrategia alternativa de Análisis Directo en Tiempo Real acoplada a espectrometría de masas de alta resolución (DART-MS) para su implementación en estudios metabolómicos, y se discutirán los parámetros que influyen en la optimización de esta técnica de espectrometría de masas que opera en condiciones ambientales.