Gabriel Riquelme- Viernes 26 de noviembre 14:00hs

Curado de datos en metabolómica no dirigida. Aplicación al diagnóstico de cáncer de próstata

La metabolómica estudia de forma sistemática los metabolitos, moléculas pequeñas con Mr < 1500, y sus procesos asociados en sistemas biológicos. En un enfoque no dirigido se intenta detectar la mayor cantidad de metabolitos para poder tener una caracterización lo más completa posible del metaboloma. La técnica de cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC-MS) es una de las más usadas para este tipo de estudios debido a que permite la detección en una muestra de miles de compuestos con diferentes propiedades fisicoquímicas y niveles de concentración. Un área en desarrollo y discusión en el campo de metabolómica es la implementación de prácticas de control de calidad, entre las cuales se incluye el curado de datos, que aseguran reproducibilidad y calidad en los resultados. En este seminario discutiremos distintas estrategias de curado de datos y su implementación en TidyMS, un paquete computacional desarrollado para este fin por el grupo de investigación. También mostraremos la aplicación de esta herramienta para preprocesar datos correspondientes a un estudio de descubrimiento y validación de potenciales biomarcadores de diagnóstico de cáncer de próstata.